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所谓倒藻是养殖水体中藻类大量死亡，导致水色骤然变清、变浊（有黄浊、白浊和粉绿色的混浊之分），甚至变红的一种现象。发生“倒藻”时，首先溶解氧会下降，二氧化碳会增加，使pH值迅速下降；其次，大量的死藻分解，会加大耗氧外，还会产生氨氮和亚硝酸盐；第三，水中的原生物会大量繁殖，反过来抑制藻类的生长。
发生“倒藻”的原因有几个方面：一是气温的突变。二是人为管理不当，包括施肥补肥时机把握不好，换添水的时间、数量不对，换添水之后没有及时保肥，消毒药用量和时间不妥等。
发生倒藻”时，水体理化因子和浮游生物短时间内发生很大的变化。一是水中少了进行光合作用的藻类，溶解氧下降，二氧化碳增加，导致pH值迅速下降，一般会在7.5以下。二，由于大量死藻的分解，会加大氧的消耗，产生氨氮和亚硝酸盐。而池塘本身的自净细菌不能及时分解大量的死藻，特别是遇上阴雨天时更明显。三，水中的原生动物大量繁殖起来，反过来抑制藻类的生长。四，缺乏藻类的沉降作用，水中悬浮物（微尘、粪便、死藻等）成混浊状态。
倒藻的处理方法：①检测pH值，偏低时用生石灰水泼洒调节；②注意增氧，特别是养殖对象规格较大或密度较大时，同时投放、抗应激和解毒的药物；③补充新水，肥水；④如果按第三步做了一次没有效果，有条件者应检测水中是否有大量原生动物，如果是则应先杀灭后再肥水；⑤有时绿色的水体变混浊后，其中会有大量的甲藻，水色是黄泥色的，此时应用灭藻剂来处理，再考虑肥水；⑥切忌盲目施放肥料、底改和活菌，以致延误时机并加大处理难度。
要强调的是，池塘一旦发生倒藻，我们看到的只是水体的某些变化，比如看到死藻、油膜、泡沫等表象，但是实际上底部的危机要远远大于水体的，因为一旦倒藻，浮在水面上的死藻只是极少的一部分，大量的死藻，有机碎屑会沉积在底部，腐败、发黑、发臭。弧菌也会附着在死藻、有机碎屑等上面繁殖滋生……
一旦倒藻，底部有机物、腐败物质累积加上水体的氧气特别是底部氧气不足，容易引起底部大量厌氧型、异养型的有害细菌滋生，很有可能引起池塘“翻底”现象……
因此，在倒藻时我们不但要进行调水，还要注重底改。比较适合的底改方式为：过硫酸氢钾消毒改底（也可以选用一些其它氧化性底改），如果池塘的增氧条件完善，建议在放过硫酸氢钾24小时后的晴天上午投放芽孢菌，利用芽孢菌分解能力强的特点来分解底部的死藻等有机物，注意要多开增氧机。
